Le Secrétariat exécutif, le Comité directeur et le Comité technique de la conférence ont été créés. Le Secrétariat exécutif se compose d'une équipe centrale chargée de la coordination d'ensemble des travaux préparatoires. Le Comité directeur exerce la compétence générale de direction sur le contenu opérationnel et technique et la structure de la conférence, dont l'encadrement, l'appui, l'examen et les autorisations finales. Le comité directeur exercera également sa compétence sur les activités complémentaires qui découleront de la conférence. Le Comité technique a pour tâche d'assurer le nécessaire encadrement de la préparation des documents et communications de la conférence, ainsi que de prêter son appui dans l'encadrement des processus nationaux, en dispensant des orientations au Secrétariat exécutif dans le dialogue avec les différents acteurs et la préparation et l'édition des documents de la conférence.

Dans les deux comités, l'Union africaine se trouvera activement impliquée est représentée. En outre, l'Union africaine désignera un responsable qui travaillera en étroite collaboration avec l'équipe de la FAO, et avec d'autres partenaires intervenant dans le projet à la coordination générale et à la bonne exécution des activités prévues.