Se han establecido el Secretariado Ejecutivo, el Comité Directivo y el Comité Técnico de la Conferencia. El Secretariado Ejecutivo está compuesto de un equipo básico responsable de la coordinación general de la fase de preparación. El Comité Directivo tiene la responsabilidad general de dirigir tanto el contenido general y técnico, así como la estructura de la Conferencia, incluyendo funciones de dirección, apoyo, revisión y aprobación. El Comité Directivo será responsable también de las actividades de seguimiento que surjan de la Conferencia. El Comité Técnico tiene el cometido de garantizar la supervisión necesaria de los documentos y presentaciones que serán preparados para la Conferencia y de igual forma apoyar la supervisión de los procesos nacionales, suministrando orientación al Secretariado Ejecutivo en lo concerniente al diálogo con los diferentes grupos de interés y la preparación y edición final de los documentos de la Conferencia.

Ambos comités trabajarán activamente con el gobierno de la Jamahiriya Árabe Libia y la Unión Africana, que contarán con representación en ellos. La Unión Africana designará, además, un oficial de conexión que operará directamente con el equipo de trabajo de la FAO y demás representantes que tienen que ver con el proyecto en cuanto a la coordinación general y la implementación de todas las actividades planeadas.