ستكون السكرتارية التنفيذية مؤلَّفة من:

• مدير قسم الأراضي والمياه في الفاو
• خبراء وأشخاص يعزى إليهم من قسم الأراضي والمياه وممثلين للأقسام الأخرى ذات العلاقة في الفاو.

ستكون السكرتارية التنفيذية وتحت إشراف اللجنة التوجيهية مسئولة عن تولّي وتنفيذ الإعداد للجوانب الفنية الأساسية للمؤتمر.

كما أنَّ السكرتارية التنفيذية مسئولة عن إجراءات التنظيم اليومية للمؤتمر بما في ذلك صياغة كافة الوثائق التي سيتم اعتمادها من قبل اللجنة التوجيهية إضافةً إلى رسائل الدعوات المعدة من قبل المدير العام ومذكرات التفاهم مع حكومة ليبيا.